Подготовка библиотек для Single-cell транскриптомики
Лекция: Введение в технологию
Юнес Роман (MGI) & Дорошенко Вероника (ЦГРМ ДВФУ)
9:00–11:30, С413
От ДНК к данным. Подготовка библиотек к полногеномному секвенированию: ключевые этапы, контроль качества и практические рекомендации
ПОВТОР: Часть 1. Фрагментация ДНК, лигирование адаптеров, очистка ДНК с помощью частиц и выбор по размеру.
Было также: 17 сентября, 14:30 – 18:30
Орлов Павел (Диа-М) & Бакланов Иван (ЦГРМ ДВФУ)
10:00-11:30, С415
Spica для визуализации живых клеток
Динамический анализ флуоресцентно-меченых клеток
Малыгина Тамара (Lacopa) & Патлай Александра (ЦГРМ ДВФУ)
10:00-11:30, С412
Подготовка библиотек для Single-cell транскриптомики
Часть 1. Подготовка клеток. Подсчёт клеток.
Повтор: сегодняв 15:10 до 17:40
Юнес Роман (MGI) & Дорошенко Вероника (ЦГРМ ДВФУ)
blank
blank
11:30–11:50
Кофе-брейк
Корпус А, уровень 12
11:30–11:50
Кофе-брейк
Корпус А, уровень 12
11:30–11:50
Кофе-брейк
Корпус А, уровень 12
11:50-12:50, С412
Подготовка библиотек для Single-cell транскриптомики
ПРОДОЛЖЕНИЕ: Часть 1. Практические занятия на TaiM4. Генерация капель. Сбор капель. Запуск реакции обратной транскрипции.
Юнес Роман (MGI) & Дорошенко Вероника (ЦГРМ ДВФУ)
11:50–13:00, С413
От ДНК к данным. Подготовка библиотек к полногеномному секвенированию: ключевые этапы, контроль качества и практические рекомендации
ПОВТОР:Часть 1. Амплификация библиотеки, очистка библиотеки
Было также: 17 сентября, 14:30 – 18:30
Орлов Павел (Диа-М) & Бакланов Иван (ЦГРМ ДВФУ)
11:50–13:20, С415
CellRiver: первый российский многопараметрический проточный цитометр и его применение в клеточной биологии и генной терапии
Иммунофенотипирование лимфоцитов периферической крови человека
Куличенкова Ксения (Bioline) & Шмелев Михаил (ЦГРМ ДВФУ)
blank
13:00–14:10, С413
От ДНК к данным. Подготовка библиотек к полногеномному секвенированию: ключевые этапы, контроль качества и практические рекомендации
ПРОДОЛЖЕНИЕ: Часть 2. Анализ качества библиотеки: флуоресцентная количественная оценка, оценка длины с помощью гель-электрофореза.
Было также: 18 сентября, 10:20 – 14:10
Орлов Павел (Диа-М) & Бакланов Иван (ЦГРМ ДВФУ)
blank
14:20–15:10
Обед
Корпус B, уровень 5, кафетерий
14:20–15:10
Обед
Корпус B, уровень 5, кафетерий
14:20–15:10
Обед
Корпус B, уровень 5, кафетерий
15:10-17:40, С412
Подготовка библиотек для Single-cell транскриптомики
ПОВТОР: Часть 1. Подготовка клеток. Подсчёт клеток. Практические занятия на TaiM4. Генерация капель. Сбор капель. Запуск реакции обратной транскриптазы.
Также было: сегодняв 10:00 до 12:50
Юнес Роман (MGI) & Дорошенко Вероника (ЦГРМ ДВФУ)
15:10–17:20, С413
От ДНК к данным. Подготовка библиотек к полногеномному секвенированию: ключевые этапы, контроль качества и практические рекомендации
ПРОДОЛЖЕНИЕ:Часть 2. Анализ качества библиотеки: количественная оценка библиотеки методом ОТ-ПЦР
Подготовка библиотек для Single-cell транскриптомики
Часть 2. Деэмульсификация. Выбор размера продукта обратной транскрипции.
Юнес Роман (MGI) & Дорошенко Вероника (ЦГРМ ДВФУ)
blank
09:30-10:00, С415
Современные методы визуализации живых неокрашенных клеточных культур и их морфологии
Повтор: 21 сентября, 9:30 – 10:00
Царева Марина (Химмед) & Якутович Дмитрий (ЦГРМ ДВФУ)
10:30–10:50
Кофе-брейк
Корпус А, уровень 12
10:30–10:50
Кофе-брейк
Корпус А, уровень 12
10:30–10:50
Кофе-брейк
Корпус А, уровень 12
10:50-13:20, С412
Подготовка библиотек для Single-cell транскриптомики
Часть 2. Амплификации кДНК. Подготовка библиотеки олигонуклеотидов. Запуск реакции ПЦР с олигонуклеотидами. Лекция по обработке данных Single cell от MGI (пока идет амплификация). Выбор размера библиотеки олигонуклеотидов. Очистка продукта кДНК, контроль качества.
Юнес Роман (MGI) & Дорошенко Вероника (ЦГРМ ДВФУ)
blank
10:50-12:20, С415
CellRiver: первый российский многопараметрический проточный цитометр и его применение в клеточной биологии и генной терапии
Обнаружение апоптоза методом проточной цитометрии
Куличенкова Ксения (Bioline) & Шмелев Михаил (ЦГРМ ДВФУ)
14:10–15:10,
Обед
Корпус B, уровень 5, кафетерий
14:10–15:10
Обед
Корпус B, уровень 5, кафетерий
14:10–15:10
Обед
Корпус B, уровень 5, кафетерий
Quality
Quality
15:10–15:40, С415
Spica для визуализации живых клеток
Анализ органоидов в реальном времени
Малыгина Тамара (Lacopa) & Патлай Александра (ЦГРМ ДВФУ)
Подготовка библиотек для Single-cell транскриптомики
Часть 3. Начало фрагментации кДНК. Лигирование адаптера кДНК. Очистка кДНК.
Юнес Роман (MGI) & Дорошенко Вероника (ЦГРМ ДВФУ)
blank
9:30-11:00, С415
Современные методы визуализации живых неокрашенных клеточных культур и их морфологии
Было также: 20 сентября, 9:30 – 10:00
Царева Марина (Химмед) & Якутович Дмитрий (ЦГРМ ДВФУ)
11:00–11:20
Кофе-брейк
Корпус А, уровень 12
11:00–11:20
Кофе-брейк
Корпус А, уровень 12
11:00–11:20
Кофе-брейк
Корпус А, уровень 12
11:20-14:00, С412
Подготовка библиотек для Single-cell транскриптомики
ПРОДОЛЖЕНИЕ: Часть 3. Выбор размера кДНК. ПЦР-аммификация кДНК. Выбор размера продукта ПЦР. Количественная оценка библиотеки кДНК и контроль качества фрагментов.
Юнес Роман (MGI) & Дорошенко Вероника (ЦГРМ ДВФУ)
blank
11:20-12:50, С415
CellRiver: первый российский многопараметрический проточный цитометр и его применение в клеточной биологии и генной терапии
Изучение клеточного цикла методом проточной цитометрии.
Куличенкова Ксения (Bioline) & Шмелев Михаил (ЦГРМ ДВФУ)